Allergene sind Substanzen (z.B. Gräserpollen), die Allergien als unerwünschte Immunantwort auslösen können. Im Unterschied zu Antigenen lösen Allergene die Bildung von IgE-Antikörpern aus. Grundsätzlich kann jeder körperfremde Stoff (Antigen) als Allergen wirken. So können etwa in Tierhaaren, Pollen, Insektengift, Hausstaubmilben, Arzneimitteln und in Nahrungsmitteln Allergene vorkommen. Gegenwärtig sind etwa 20.000 solcher Allergie-auslösenden Stoffe bekannt. Eine Allergie-auslösende Substanz kann mehrere Allergene beinhalten, bei Soja wurden beispielsweise ca. 15 verschiedene Allergene identifiziert.